Doğa Karakaya, kömürleşmiş tohum ve meyve kalıntılarının tanımlanmasında uzmanlaşmış bir araştırmacıdır. 2019 yılında Tübingen Üniversitesi’ndeki Arkeolojide Doğal Bilimler Enstitüsü’nde doktora tezini tamamlamıştır. Doktora tezi, Türkiye’nin güney-orta kesimindeki bir Erken Bronz-Demir Çağı yerleşimi olan Tayinat Höyük’ün bitki makro-kalıntıları üzerinedir. Ayrıca, Türkiye’de birçok farklı Bronz ve Demir Çağı araştırma projesinde yer almıştır. Uzun vadeli araştırma ilgisi, Yakın Doğu’daki çevresel ve politik istikrarsızlıkların geçim ekonomisini nasıl etkilediği, özellikle Geç Tunç Çağı-Demir Çağı geçiş döneminde bölgedeki toplulukların bu değişikliklere nasıl tepki verdikleri konularını kapsamaktadır. Halen, aynı bölgede bulunan Zincirli Höyük’teki Orta Tunç Çağı ve Demir Çağı bitki makro kalıntıları konusunda Tübingen Üniversitesi’nde doktora sonrası araştırmacı olarak çalışmaktadır. Bu çalışma, Türkiye’nin güneydoğu kesimini yukarıda adi gecen her iki dönemde de istila eden göçebe toplulukların çevresel koşullar üzerindeki etkilerini çevre arkeolojisi yöntemleri yoluyla ortaya çıkarmayı amaçlayan daha geniş kapsamlı bir projenin parçasıdır.